大肠癌微卫星不稳定性的新清除IVD分析旨在帮助识别林奇综合征

林奇综合症是一种遗传性疾病,它会显著增加患结肠直肠癌和其他癌症的风险,通常发生在年轻人身上。患有这种疾病的人在他们的一生中有接近80%的机会发展成结直肠癌。它是最常见的遗传性结肠癌,约占所有结肠癌的3%。导致林奇综合症的突变是以常染色体显性遗传的方式遗传的,这意味着你只需要有一个带有林奇相关突变的基因副本,就会增加风险。

据估计,每279人中就有1人遗传了林奇相关的突变(1)。然而,尽管林奇综合征发病率很高,但人们并不了解它,大约95%的林奇综合征患者不知道自己患有它(1)。

林奇综合症的原因和检测

林奇综合症是由突变引起的,突变导致四种主要错配修复蛋白中的一种功能丧失。这些蛋白质作为“证据阅读器”,纠正DNA序列中可能发生的DNA复制错误。为了确定林奇综合症是否可能发生,可以对肿瘤组织进行简单的筛选试验,以表明是否应该考虑进行更具体的基因检测。其中一种筛查是在肿瘤组织中寻找高水平的微卫星不稳定性(MSI)。肿瘤组织中的高微卫星不稳定性(MSI-H)是一个功能指示,一个或多个主要错配修复蛋白功能不正常。

观看这段短视频,了解有关微卫星不稳定的更多信息。

对于那些在很小的时候就罹患大肠癌或有家族病史(直系家庭成员或多个家庭成员患有大肠癌或息肉)的人来说,林奇综合征的筛查可以为患者及其家人以及他们的医疗保健提供者提供有价值的洞见。

新的MSI IVD检测有助于识别林奇综合征

Promega OncoMate™MSI Dx分析系统具有获得了FDA的批准作为一种IVD医疗设备(链接到Press Release),可以用来确定大肠癌肿瘤的MSI状态,以帮助确定那些应该进一步检测林奇综合征的人。OncoMate™MSI Dx分析系统建立在公司15年的历史上,支持全球癌症研究人员的MSI状态检测的领先标准测试之一。OncoMate™MSI Dx分析系统提供了一种改进的配方,同时使用了同样的五个标记物,这五个标记物已成为研究社区中MSI检测的金标准,并被140多个同行评审出版物引用(2,3)。

OncoMate™MSI Dx分析系统旨在为医生提供具有功能性的,分子测量的DNA错配修复缺乏水平,在其患者的结肠直肠癌肿瘤内表现出来。建议使用MSI测试来识别候选人,以便对林奇综合征进行进一步诊断测试。(2-4)。该系统是更广泛工作流程的一部分,包括来自FFPE组织样本的DNA提取,DNA的定量,使用多重PCR的特异性微卫星标记的扩增,通过毛细管电泳的片段分离,以及数据分析和解释软件。某些国家/地区提供了onComate™MSI DX分析系统。访问OnComate™MSI DX分析系统网页了解更多。

Promega此前宣布在法国,德国,奥地利,波兰,英国,爱尔兰,比利时,荷兰,卢森堡,西班牙,意大利,瑞士,丹麦,瑞典和挪威的CE标记版本的CE标记版。

有关MSI解决方案的更多信息,请访问我们的微卫星不稳定性测试网页

参考

  1. 赢,a K。et al。(2017)癌症流行病。上一步。26,404-12。
  2. 巴彻,J。et al。(2004)分离标记20.,237-50。
  3. Svrek,M.et al。(2019)公牛。癌症,106.119 - 28。
  4. 奥马尔,。et al。(2004)j .国家的。癌症本月。18261 - 8。

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10年前,世界上失去了一位先驱免疫学家和生物化学家Jürg Tschopp博士。2011年3月22日,他在瑞士阿尔卑斯山徒步旅行时不幸去世。许多学术期刊,包括科学自然细胞他在讣告中强调了Tschopp博士在细胞凋亡和免疫学领域的诸多成就。

2002年,瑞士洛桑大学(University of Lausanne)的Tschopp博士领导的一个团队正在研究促炎细胞因子白介素1β (IL-1β)的作用。这种细胞因子作为非活性前体(pro-IL-1β)在细胞质中产生。它被caspase-1切割成活性形式,但caspase-1本身被激活的确切过程当时还不清楚。caspase家族的几个成员包含一个被称为caspase招募域的保守区域并且提出了该结构域对Caspase活化至关重要。

基于与另一种包含n端CARD基序的蛋白(Apaf-1)的相似性,该蛋白参与caspase-9的激活,研究人员检查了名为NALP1、NALP2和NALP3的蛋白家族的作用(1)。特别是,他们对NALP1感兴趣,它参与免疫反应。与Apaf-1不同,NALP1在C端包含一个CARD基序,而N端包含一个相关基序,称为pyrin-like domain (PYD)。该研究小组此前已经证明NALP1的PYD区域与一个名为PYCARD或ASC的适配器蛋白相互作用,后者也包含一个n端PYD和c端CARD。

该团队的体外结合、激活和免疫检测研究结果表明,一个多单位蛋白复合物负责caspase的激活,他们将此复合物称为“炎性小体”(1)。它由caspase-1、caspase-5、PYCARD/ASC和NALP1组成。

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由不同的SARS-CoV-2谱系驱动的巴西两次COVID-19浪潮

2020年,巴西亚马孙州经历了两波不同的COVID-19感染浪潮。在第一波之后,圣保罗大学的一个团队预计玛瑙斯市将在夏季结束时达到群体免疫的理论门槛然而,第二波COVID-19浪潮在2020年12月爆发,与变异型关注(VOC) P.1的上升同步。

冠状病毒COVID-19三维模型

一项新研究发表在自然医学通过时间检查了巴西的Covid-19的不同谱系,并确定了两波被不同的变体驱动。第一波由Variant B.1.1.195驱动,从春天从欧洲进口。第二波主要由VOC P.1驱动。的自然医学该研究首次使用2020年全年收集的样本中的病毒序列,探索两波不同的COVID-19浪潮背后的流行病学和病毒学因素。

检测亚马逊样品中的VOC p.1

研究人员首先生成了2020年3月至2021年1月收集的250份SARS-CoV-2样本的全基因组序列。调查结果表明,20%的序列属于B.1.195谱系,这些序列大多对应于第一指数生长期。24%的样本属于P.1谱系,所有这些样本都与第二指数生长阶段的上升相对应。B.1.1.28占最大份额(37%),在第一波之后不久取代B.1.195成为巴西的主要变体,直到VOC P.1的上升。

该团队还使用实时RT-PCR分析了2020年11月1日至2021年1月21日期间在亚马逊收集的1232个阳性样本。本实验旨在检测VOC P.1的标志性突变NSP6的缺失。12月16日之前采集的样本均未出现NSP6缺失,但12月中旬开始采集的样本中NSP6缺失较为常见。结合这两种分析方法,该团队在2020年11月收集的样本中发现了0%的P.1谱系,但到1月1日至15日,在73.8%的样本中存在P.1谱系。

这一数据支持了2020年12月首次出现VOC P.1的理论,并是驱动亚马逊第二次浪潮的主导谱系。

COVID-19的两次浪潮:病毒学和流行病学因素

除了在整个大流行期间跟踪血统的流行,研究人员还对亚马逊经历了两波不同的COVID-19感染浪潮提出了建议。

通过计算机建模,该团队发现,在2020年4月至5月,血统B.1.195和B.1.1.28的繁殖效率(Re)显著降低,大约在同一时间,亚马逊增加了社会距离措施。在2020年9月干预措施放松之前,传播率一直很低。这表明病例的减少不是由于群体免疫.相反,非药物干预措施(NPI)限制了第一波,并在整个夏季遏制了传播。

使用实时RT-PCR,研究人员发现,P.1感染的病毒载量是非P.1感染的病毒载量的几乎十倍。他们还引用了其他研究,发现VOC P.1对人受体ACE2具有更强的亲和力,而不是B.1.1.195和B.1.1.28。P.1显然是一种高度传输的VOC,它在理想的环境中演变为快速蔓延。亚马逊在2020年代后期,P.1能够迅速达到极高的感染率。

这项研究没有直接解决P.1逃避先前感染产生的免疫的理论,但他们得出结论,流行病学和病毒学因素的组合使P.1从12月开始在亚马逊引发了第二波COVID-19。

该报告还补充指出,2021年1月在玛瑙斯设立的npi显著降低了VOC P.1的传播率。研究小组在论文的最后重申了适当的社会距离措施的重要性,以限制COVID-19的传播,防止新的担忧变体的出现。

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本研究采用Maxwell®RSC病毒总核酸纯化试剂盒从样本中提取病毒RNA。了解更多有关该试剂盒及其在COVID-19大流行期间的使用情况在这里


溶瘤病毒:用于开发可杀死癌症的病毒的模型和测定

当我们想到病毒时,我们经常会想到疾病,流行病和死亡。我们对病毒的印象是它们是“坏”。但病毒也可能成为现代历史中最致命的疾病的可能治愈:癌症。在一个世纪以前,记录了“好”癌症杀菌病毒的治疗效果。早在1904年早期的记录描述了一名42岁的女性,患有急性白血病的急性白血病,在流感感染后经历了临时缓解。其他早期报告显示出在麻疹病毒自然感染后Hodgkin淋巴瘤和Burkitt的淋巴瘤的自发缓解。

尽管历史悠久,溶瘤病毒只是最近才在科学界得到发展。奥米斯生物科技公司(一家位于旧金山湾区的生物科技创业公司)的首席技术官和联合创始人奥尔多·波切特博士决心利用溶瘤病毒的力量来开发新一代癌症免疫疗法。

溶瘤病毒是如何工作的

“我们肯定知道的一件事是您需要免疫系统来对抗癌症,”林德卷说。“你需要招募免疫系统,可能是我们招募免疫系统的最佳事情是病毒。我们的免疫系统进化以立即检测它们。这就是我们仍然在地球上的原因。这是因为我们能够对抗致命病毒。“

继续阅读溶瘤病毒:开发杀死癌症病毒的模型和试验

获得实验室研究经验

今天的客座博客是由Melissa Martin撰写的,她是Promega今年夏天的全球营销实习生。今年秋天,她将成为威斯康星大学麦迪逊分校(University of Wisconsin-Madison)的大四学生,在那里她主修动物学和生命科学传播,并获得了环境研究证书。

恭喜!您正在参加大学并追求一个挑战,但有益的本科学位。到目前为止,可能包括在申请梦想学院的时候花了很多深夜花费。但是,现在您在这里您会发现类提供大量信息。通过在研究实验室中获得实际的经验,您甚至可以进一步接受您的教育。

在实验室工作不仅仅是为了让你的简历好看。它提供了一个真实世界的经验,直接提高你的学习经验,甚至可以指导你的未来。例如,你在实验室的经历可以教会你基本的技能(移液、测定浓度、进行滴定等),这将在各种科学专业中很有用。

继续阅读“接触实验室研究经验”

免疫检查点生物测定在新疗法的发展中加强癌症研究

本文由Promega GmbH产品管理支持的客座博主Nicole Werner撰写。

“你有癌症。——这句话会在一瞬间从根本上改变你的生活。在第一次震惊之后,通常会出现这样的想法:“要是我早点戒烟就好了!”

肺癌虽然不是世界范围内的主要死亡原因,但在发达国家却是可预防的主要死亡原因。据世界卫生组织统计,每年有800万人死于吸烟,其中100万人死于被动吸烟。目前,80%的患者在诊断为[1]后的13个月内死亡。新的治疗方法,如免疫检查点抑制剂的治疗,带来了希望。

Promega用开发这种新型疗法所需的高精度工具支持这一领域的研究。

免疫检查点信号的艺术3D渲染。免疫检查点生物测定使研究人员能够描述针对这些途径的治疗性抗体。
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RIPK1:有前景的慢性炎症药物靶点

今天的帖子由记者和信号高级产品经理Michael Curtin撰写。

炎症是机体利用的一种防御机制,免疫系统在其中识别并消除有害的外来刺激,并开始愈合过程。炎症可以是急性的也可以是慢性的。慢性炎症也指缓慢的、长期的炎症,可以持续很长时间(几个月到几年);慢性炎症是由免疫失调引起的。这通常表现为身体无法解决由炎症细胞因子和趋化因子过度产生的炎症,以及死亡细胞释放的危险相关分子模式(DAMPs)(2)。肿瘤坏死因子(TNF)是参与许多常见炎症疾病的主要细胞因子,也是许多针对炎症的治疗的重点。

像RIPK1这样的激酶的信号转导可以使用NanoBRET靶结合分析来研究

最近的研究,RIP激酶(RIPK1和RIPK3)是通过细胞胁迫期间细胞死导的关键作用,并在暴露于炎症和传染性刺激之后,是先天免疫的重要调节因素。RIPK1在促炎信号传导中具有重要的脚手架作用,其中它与TRADD,TRAF1 TRAF2和TRAF3和TRAFD在TNF依赖性过程中招募RIPK1至TNFR1复合物的适配蛋白。RIPK1在凋亡和坏死性细胞死亡中起着激酶活性依赖性作用。一篇审查文章Speir..(1)探讨RIP激酶在慢性炎症中的作用及裂口抑制剂的潜力作为治疗慢性炎症的新治疗方法。RIPK1或受体相互作用蛋白激酶1是丝氨酸/苏氨酸激酶,其最初被鉴定为与Fas的细胞质结构域相互作用。Promega提供了几种试剂,使RIPK1更容易 - 这些包括我们的RIPK1激酶酶系统其中包括RIPK1(人,重组;氨基酸1-327)、髓鞘碱性蛋白(MBP)底物、反应缓冲液、MnCl2,和DTT和优化使用与我们的ADP-Glo激酶试验

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克服在三维细胞结构中检测凋亡的挑战

本博客由嘉宾作者,Promega公司高级产品经理Maggie Bach撰写。

研究人员越来越依赖于在三维(3D)结构中生长的细胞来帮助回答他们的研究问题。单层细胞或2D细胞培养是过去一个世纪最流行的细胞培养方法。现在,需要更好地在体内条件下表现采用3D细胞培养模型.在三维结构中生长的细胞能更好地模拟组织样结构,更好地显示分化的细胞功能,并能更好地预测体内对药物治疗的反应。

转换到3D细胞培养模型是有挑战的。询问这些模型的方法需要适应和可靠的多种类型的3D模型。一些最流行的3D模型包括在超低附着板中生长的球体,以及在细胞外基质中生长的细胞,如康宁的Matrigel®。更复杂的模型包括微流体或芯片器官设备中细胞上的介质流动。最初为单层细胞培养而开发的实验是否能与各种3D模型一致?与单层细胞生长相比,在3D模型中生长时测量细胞标记物有何不同?

3D培养设备中细胞的特写。三维细胞结构为测量细胞活性标记物提供了挑战
三维细胞结构为测量细胞活性标记物提供了挑战
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世界萤火虫日:让更多的光照亮发光技术创新

2021年7月3日和4日,我们庆祝世界萤火虫日。今年,2021年,标志着荧光素酶产品的30年,萤火虫荧光素酶载体和荧光素酶检测系统.这些工具是推进生物发光技术的关键。为了庆祝这一天,我们想强调这些工具带来的一些创新。

继续阅读“世界萤火虫日:更多地关注发光技术创新”

生物技术多样化:D.O.O.R.S.奖学金赋予年轻科学家力量

DOORS奖学金代表我们研究科学家的多元化。

2020年,Promega North America推出了我们的研究科学家(门)奖学金的多样化,以认识到来自代表性不足的背景的学生。十名学生获得了5,000美元的学费和与其教育相关的其他费用,以及与Promega的导师的联系。这是他们的两个故事。

继续阅读生物技术多样化:D.O.O.R.S.奖学金赋予年轻科学家