自动化法医DNA净化以满足紧急需求:2001年9月11日的思考

2001年9月,Allan Tereba(Center,Blue Polo)与纽约市政办公室纽约市政办公室的技术人员合作,讨论自动化法医DNA Plification。
2001年9月,Allan Tereba(Centre,Blue Polo)与纽约市首席医学审查员(OCME)办公室的技术人员合作。

2000年夏天,Promega研究科学家Allan Tereba被要求为法医开发一种自动净化DNA的协议。他的团队最近推出了DNA IQ,这是第一个使用磁珠纯化法医DNA的Promega试剂盒。那是在Maxwell®仪器和Promega纯化化学广泛适用于高通量自动化之前。

艾伦说:“我怀疑自己是否能够做到这一点。”。“当你处理STR时,少量的污染DNA会扰乱你的结果。但我继续尝试了,这是一个挑战。”

一年后,艾伦在他的办公室里听到了一架飞机在纽约市世界贸易中心北塔袭击的收音机中。不久之后,他听到第二架飞机袭击了南塔的宣布。

到那个点,艾伦和他的同事成功地调整了DNA IQ,以便在机器人的甲板上使用。在攻击时期,Promega科学家支持纽约市政办公室的首席医学审查员(OCME),纽约州警察在他们的工作中识别从地面零恢复的人类遗体。

多亏艾伦和许多其他Promega科学家的努力,Promega准备为紧急需求提供独特的解决方案。用他们自己的话说,以下是这些科学家的一些思考。

自动化法医DNA纯化

Allan Tereba,高级研究科学家*:2000年底,我的老板来找我说:“我想让你把DNA智商加到一个机器人系统上。”我说:“好吧,这很难。我想在那个时候,有一些机器人系统可以净化DNA,但它们只是作为参考样本。我们必须设计一个磁铁,正好适合96孔板。我得花时间学习如何给机器人编程,不过最难的是如果你想从珠子上提取DNA,你必须加热它,然后使劲摇晃它。我很害怕,因为风险很大,但实际上效果很好。我用深井盘和相当少量的液体。我做了一些实验,做了一些聚合酶链反应测试,看看是否有交叉污染,我在对照中没有看到任何东西。就在那时我说"天啊,这能行"

2001年初,在完善了该方案后,艾伦和其他几位Promega科学家与弗吉尼亚州的一个犯罪实验室合作,对自动化系统进行了测试。

我飞到那里设置了系统。我们向他们展示了所有的东西是如何工作的,当谈到颤抖的部分时,他们的眼睛变得疯狂,他们说,‘这不管用。’我们告诉他们只需要整理一下样品,然后我回到了Promega。当他们把所有的东西都整理好的时候,他们的空白是完全空白的。

Paraj Mandrekar,研究科学家*:8月和2001年9月初,我正在研究从小组块中分离DNA。我正在手动这样做,但以一种可以适应机器人的方式。我记得“我不知道为什么我们会这样做,”但是我可以在机器人上做一些组织,就像88的时候。然后一个星期半后来,人们就像“嘿,你是在机器人上玩过的组织吗?因为我认为这就是我们现在需要的东西......“

2001年9月11日,阿尼·马西贝(Arni Masibay)听到有关袭击的消息时,正在佛罗里达州的家中办公。在最初的冲击消退后,阿尼意识到Promega处于一个独特的位置,可以支持一些后续工作。

法庭区域客户经理Arni Masibay:它突然出现在我的脑海中,他们将不得不收集和收集所有的样品,将它作为一个犯罪现场,我不知道他们会做多少,但这是我发现的一个挑战,Promega可以是有益的。当时,我非常了解GI研究科学家正在进行的项目,其中之一就是自动化。所以我试着联系纽约首席法医办公室接电话的人是一个实验室主任,我以前没和他说过话,但当我解释我想做什么时,我清楚地记得他说:“我就是你要找的人。”

Michelle Mandrekar,研究科学家:在他们将测试之前,我们需要表明[DNA IQ]可以纯化线粒体DNA,以防它是降解样品,无论是直接崩溃还是直到收集它的时间。我对哺乳动物的这些保守序列有底漆,因此在9/11,帕拉和我在该实验室进行了一个星期六,展示了PCR,表明我们可以提取线粒体DNA。我们能够表明该线粒体序列可以在DNA IQ样本中检测到。能够做点什么真是奖励。每个人都在看着对方,“我们该怎么办?”我们实际上必须在实验室中,我们必须做一些可以帮助人们的事情。

确定9/11受害者

2001年9月17日,一群普罗姆加科学家在内的普通科学家(包括Allan Tereba和Arni Masibay)飞往纽约市,以便在首席医学考官(OCME)办公室的人类遗留下的自动DNA净化。

七天后,Bob McLaren在纽约州警方飞往奥尔巴尼时加入了该小组,纽约州警察正在准备从失踪人员处理参考样本。

Arni Masibay:我们是最早飞往纽约的飞机之一。当我在飞机上时,我回忆起一种奇怪的感觉,因为它是如此安静。当我们着陆时,每个人都在鼓掌,你几乎可以在飞机上轻松地放松下来。

纽约市首席法医办公室将帕奇交给了艾伦·特里巴因为他参与了911袭击的反应。

Allan Tereba:到处都是士兵,我们必须通过三个检查站。他们会问我们,“你们为什么在这里?”你为什么想进去呢?”他们翻了我们的行李,背包,所有东西。我们去了OCME所在的大楼我们对他们建立的机器人系统进行了编程。那是一段令人筋疲力尽的时光。我们每天工作12个小时,也许更多,然后回过头来,写下我们所做的。

Paraj Mandrekar:我的工作转向了在Promega校园进行实验,然后向场传达出来。例如,其中一个问题是许多组织样本不在它们使用的条件下溶解。因此,我们在现场设置实验,然后在工作中解雇电子邮件和更新,以及什么不起作用。

Allan Tereba:但这还不是故事的结局。当您试图识别样本时,还需要参考样本。奥尔巴尼的纽约州警察实验室正在研究牙刷、梳子和其他物品。我们飞到那里去建立另一套机器人系统。

Bob McLaren,技术服务科学家*:我将永远记住的事情之一就是当我们走进去时,有一个机器人设置,我们要做我们的编程,但在实验室周围都是棕色纸袋,所有这些包包都有人们的名字。那些是遗失的人的参考样本。那种击中家 - 这是人们的生命。那些不再和我们一起的人。所以,当你走在实验室时,你就会注意到这一点。你知道这就是你在这里做的事情。我永远记得那个景象。


二十年后,奥克姆还在工作以识别遗骸从世界贸易中心恢复,使用最新的DNA识别技术。

在我们缅怀2001年9月11日的事件和缅怀那些失去生命的人之际,我们向所有为DNA鉴定技术奠定基础的科学家们,以及所有继续致力于进一步推动这些技术的人表示感谢。


*职位名称反映2001年的职位。
2006年从Promega退休的Allan Tereba。
Paraj Mandrekar现在是一名技术服务科学家。
鲍勃·麦克拉伦现在是高级研究科学家。


马克愿望,纽约市首席医学审查员办公室助理主任将在第32国际人体识别研讨会上提供主题演讲(ISHI)。他的演讲将与世界贸易中心受害者的Ocme法医科学家和家庭的困难和毅力谈判,以及正在进行的工作,以确定当天失去生活的所有人。小组还将讨论全世界的法医学科学的进步,这导致了9/11调查的二十年。注册会议ishinews.com。


要了解有关法医DNA分析的进展,请查看我们最近的文章,骨子里的故事:9/11事件20年后的DNA法医分析


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Jordan Villanueva在2017年加入Promega之前在西北大学学习写作和生物学。作为一名科学作家,他最感兴趣的是科学中人性的一面——杂志文章背后的故事和人物。研究兴趣包括免疫学和神经科学,以及新冠病毒-19大流行。当乔丹不工作的时候,他喜欢把酸面包烘焙变成一门科学。这只是酵母和乳酸菌的共生培养物,对吗?

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