利用技术的力量进行病毒爆发

艺术家的病毒粒子的再现。

当世界遇到病毒大流行,科学家和卫生官员很快希望数据驱动的答案来了解情况,更好地制定公共卫生反应。技术提供了研究人员可以用于开发快速排序协议的工具。利用这种协议,产生的数据可以帮助回答有关疾病流行病学的问题,并理解宿主和病毒之间的相互作用。甚至更好:如果协议是自由的,并且基于便宜的移动排序系统。

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朝向零饥饿,一次一个基因组

农民和一堆木薯灯泡。

你有没有想过植物病毒?除非你是农民或狂热的园丁,否则可能不是。然而,对于许多人来说,对抗农业病毒的战斗永远不会结束。植物病毒每年都会导致数十亿美元的损害,并留下数百万人粮不安全(1-2),使病毒成为2030年零饥饿的联合国全球可持续发展目标的主要障碍。

在西澳大利亚大学,高级研究员Laura Boykin博士正在使用基因组学和超级计算来解决病毒植物疾病的问题。在最近的一项研究中,Boykin博士和她的同事使用基因组测序来告知疾病管理在木薯作物中。对于这项工作,他们使用了矿物,一个微型,便携式序列仪牛津纳米孔技术,完全序列感染木薯植物的病毒的基因组。

木薯(Manihot Esculenta)是全球5个最重要的卡路里源之一(3)。超过8亿人依靠木薯食物和/或收入(4)。木薯易患叫做Begomoviruses的一组病毒,这些病毒由粉底传播。可提供抗性木薯品种。然而,这些抗性植物通常仅受到少量的原毛病毒,因此适当部署这些植物意味着农民必须知道他们的植物是否被感染,如果是的话,那么导致感染的病毒菌株。继续阅读“一次走向零饥饿,一次一个基因组”

Christensenellaceae-一种自然的瘦身方式?

微生物组研究表明细菌殖民者如何影响健康一项研究发表于11月6日问题细胞概述的结果表明,一种模糊的细菌系列人体肠道可能是遗传的,并且也可能对体重有直接影响。本文是第一个识别这种关联的并将特定的微生物殖民主人与较低的BMI联系起来。继续阅读“克里斯滕尔科西雷 - 一种自然的瘦身方式?”

学习1000美元的基因组

个性化的药物在最近的人类识别国际研讨会上,Kevin Davies,主题演讲者和作者1000美元的基因组,具有人类基因组排序努力的娱乐与历史的与会者,并讨论了所产生的信息渗透我们的日常生活的方式。显然,有足够的物质填写一本书,但我将在这里描述他的谈话中的一些高点。

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一种:揭示使用单细胞测序的微生物暗暗物质

抽象数字背景微生物;它们是最丰富的生活形式。他们都在我们身边,沉默,看不见和未被发现。每年夏季和细菌的“物种”的数量攀登,预计持续超过一百万(1)。尽管他们丰富,但我们对这些不同的细胞生命形式的一小部分甚至一小部分,因为我们无法在实验室环境中培养大部分。事实上,我们所有的微生物分离株的88%属于四种细菌植物(植物,常规,肌动菌和菌株; 2)。微生物系统发育树的剩余分支范围从代表性的多样化为几乎未知,并且统称为“微生物暗物质”。

如果您想定位那些隐性的暗示性分支,其中异国情调和异常的有机体所属的,您将进入可能陷入困境的环境。为此,基督徒陆克克和一个大联盟的共同作者收集了各种各样的栖息地的样本,包括南大西洋热带景观,南达科他州的霍比矿,在内华达州的伟大沸腾的春天,底部的沉积物在希腊的Etoliko泻湖甚至是生物反应器。继续阅读“一种力量:揭示单细胞测序的微生物暗物质”

人类基因组序列的正在进行的遗产

当宣布人类基因组的第一次草案序列时,我是一个实验室的研究助理威斯康星基因组中心在那里我创建了用于测序的细菌基因组的霰弹枪文库。当然,当地新闻机构都是充值的新闻,并寻求关于这对未来的意义的意见,包括实验室的PI和奇怪的是我自己的。虽然我不记得我在相机上提供的确切词语,但我相信他们是沿着这条线的东西,这只是人类遗传学未来的第一步。十年后,我们还没有满足宏伟的歌词用于报告第一个序列的潜力,但是已经获得了足够的知识,了解我们的基因组只有更多的阴谋科学家。

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